أسست جامعة الزيتونة الأردنية عام 1993، وهي تسعى منذ تأسيسها لإعداد الطالب إعداداً علمياً وخلقياً، ليكون قادرا بالنهوض بمسؤوليته في خدمة وطنه وأمته. بدأت جامعة الزيتونة الأردنية مسيرتها المتميزة في موقعها وبنائها، فهي تتميز بموقعها المطل وأبنيتها ذات الطابع الهندسي الجميل، ثم امتد التميز إلى المرافق الأساسية والتجهيزات العلمية. فالجامعة تعتني عناية فائقة بمرافقها الأساسية، ولاسيما مكتبتها العامة التي تعدّ أحد معالم الجامعة الرئيسية والمختبرات العلمية التي تضم أحدث التجهيزات والمعدات العلمية، كما تولي الجامعة اختيار كوادرها الأكاديمية والإدارية اهتماماً خاصاً، وذلك انطلاقاً من فلسفتها التعليمية الرائدة المرتكزة على تقديم التعليم الجامعي المميز للطالب، بما يتوافق مع إمكانياته الشخصية وقدراته الإبداعية.
احتلت الجامعة المرتبة 320 في التصنيف العالمي الجرين ميتركس وحصلِت على شهادةِ ضمانِ الجودةِ العالمية الأيزو في جميع مكوناتِ عملها الأكاديميةِ والإداريةِ، لتكونَ أولَ جامعةٍ أردنيةٍ تحصلُ على هذه الشهادةِ بنسختها الحديثةِ التي تركزُ على القيادةِ وإدارةِ المخاطر. وحصلت كلٍ من كليتي الصيدلةِ والتمريضِ على شهادة ضمانِ الجودة الأردنية التي تمنحها هيئةُ اعتماد مؤسسات التعليمِ وضمان جودتها حيث عملت الجامعة على انشاء نظام متكامل لادارة الجودة ووصلت إلى مراحل متقدمة ومتجذرة في هذا المجال.